在反滲透膜分離設備運行期間，由于沉淀物，膠狀物質，有機物和微生物的存在以及原水中不溶物的沉積，使反滲透膜的表面沉積。這通過膜分離過程引起反滲透膜的污染。

　　示例：不正確的預處理，不合理的設備操作等：

　　配備有該系統(tǒng)的預處理單元不適合原水質量和流量，或者沒有配備必要的過程設備和系統(tǒng)的過程鏈接。預處理器無法正常工作。換句話說，系統(tǒng)的原始預處理設備具有SDI配置和原始濁度。粘合劑等的去除能力低，預處理效果不令人滿意。系統(tǒng)選擇了不合適的設備或未正確選擇設備材料；間歇運行或系統(tǒng)關閉后，設備未采取適當?shù)谋Ｗo措施；運營管理人員未進行合理的設備操作。

　　膜分離系統(tǒng)中不溶性沉淀物的長期積累；來源的組成已發(fā)生很大變化，或者來源的特征發(fā)生了根本性的變化。反滲透膜系統(tǒng)經歷了嚴重的微生物污染等。

　　反滲透膜的污染會降低膜的性能，例如減少系統(tǒng)水的產生和增加鹽的滲透性。但是，在使用反滲透設備時，應格外小心，因為膜特性（壓力，溫度等）的變化可能會被其他因素掩蓋。

　　反滲透膜分離系統(tǒng)配備了預處理設備，可去除盡可能多的材料，從而造成膜污染，但是即使在使用過程中未完全污染膜，也應清潔反滲透系統(tǒng)。

　　實踐表明，不除去引起一定程度污染的反滲透系統(tǒng)，很難完全除去附著在膜表面的污染物。

　　如果反滲透系統(tǒng)顯示以下現(xiàn)象，則需要進行化學或物理清潔。

　　在正常的供水壓力下，產水量比正常水平低10-15％，產品水質下降10-15％，鹽滲透性提高10-15％。

　　為了維持正常的水生產，溫度補償?shù)墓┧畨毫υ黾?0-15％，膜分離系統(tǒng)壓力差增加，并且壓力差比初始壓力差高15-20％。